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物种多样性、基因功能、样本差异分析
以特定环境(土壤、水体、肠道等)中微生物群落作为研究对象,通过提取环境中微生物群落的总DNA,不需要对环境微生物进行分离培养,利用高通量测序,进行生物信息学分析。
可用于:物种多样性分析:研究环境微生物的群落结构、估计物种丰度;
基因功能分析:构建环境微生物的非冗余基因集,基因功能注释,估计基因的丰度;
样本差异分析:比较不同分组之间的差异基因,统计差异基因富集的代谢通路和GO分类,比较不同处理间的差异物种